Es einer der grossen Vorteile von Gentoo, dass Du für die Installation nicht an ein bestimmtes Medium gebunden bist. Du kannst jede x-beliebige Live-CD nehmen (die wget, tar und chroot hat), und damit die Installation durchführen. Du kannst also auch komplett alles (Mit Ausnahme der Partitionierung) von deiner laufenden Ubuntu durchführen.
Ich hatte schon zwei mal Gentoo bei laufendem Windows installiert! Man muss ja schließlich weiter arbeiten
Die Werkzeuge hierfür waren eine Bochs
http://bochs.sf.net mit Demo Debian und konfiguriertem Zugriff auf eine reale Partition. Die Live-CD musste ich nur 1x zum partitionieren und 1x zum Installieren von Grub starten.