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Hallo!

Ich habe unter Gentoo noch keine Erfahrungen mit 4.5/4.6 gemacht, aber unter Ubuntu schon. Ich verwende auch nur ein Bildschirm.
Das wird jetzt Deine Frage in Gentoo zwar nicht direkt beantworten, so richtig besser ist der Aufbau aber erst ab 4.6 (von KDE her, das ist jetzt unabhängig von der Distribution).

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Wo Du ein Monitor hattest war die Belastung auch gross, oder erst ab dem zweiten?

Nur so ein Paar Ideen:

-Schau mal als Test an, ob etwas besser wird, wenn Du bei den Effekten den Fensterschatten abschaltest.
-Würde ich das gleiche auch mit Gleiten ansehen.
Das sind zwei Sachen, die manchmal heikel sein können.

Eventuell:
Unter Arbeitsflächen-Effekte einrichten die Option Funktionsprüfungen deaktivieren setzen, falls es noch nicht so ist.