Ahhhh... Wenn man das Szenario kennt, ist es einfacher mitzudenken.
Was hälst Du davon, dass Du Portage nicht mehr mit "emerge --sync" aktualisierst, sondern mit einer Versionsverwaltung?
Dann kannst Du Dir den alten Stand (Revision) merken und jederzeit zurück kehren.
Auschecken kannst Du von
http://anoncvs.gentoo.org/ per CVS, SVN oder GIT (Repository gentoo-x86).
Git wäre von Vorteil, da alles lokal vorgehalten wird, du also auch ohne Netz zurück kannst.