Es kann passieren dass udev, openrc, systemd anfangen irgend welche Kernel-Features zu benötigen die im alten Kernel noch nicht da sind. In dem Fall würde aber Portage Dich drauf hinweisen.
An sonsten würde ich es so handhaben: Solange eine Kernel-Version noch im Portage drin ist, kann man diese auch verwenden. Das selbe gilt übrigens für alle Portage-Pakete. Und im Portage liegt sogar noch die gentoo-sources-3.4.113 rum.
4.0.5 - 4.0.9 sind raus, diese würde ich also nicht mehr nutzen sondern zumindest auf 4.1 gehen.
Auch wenn Open-Source kostenlos ist, ist sie nicht umsonst. Dein Preis ist Dein Engagement und Mitarbeit an OS-Projekten.
Wenn Du keinen Preis bezahlen willst, bist Du die Ware. Und das ist nicht Open Source, geschweigedenn frei.