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Die Fachbegriffe für das was Du suchst sind "Data-Warehouse Cubes" (Groß) "Data-Marts" (Klein)," OLAP".
Mir ist leider keine Linux- oder Open-Source DWH Lösung bekannt.
Wenn Du dich mit einer einfacheren Lösung zufrieden gibst, hast Du zwei Möglichkeiten der Datenhaltung:
1. Alles in einer Tabelle (alle Kombinationen, = viele Redundanzen)
2. Relational abgebildet (Pro Dimension eine Tabelle mit Schlüssel + Datentabelle mit Dimensionsschlüsseln + Werte) = http://de.wikipedia.org/wiki/Sternschema
Als Frontend eignen sich OpenOffice ("Datenpilot") oder MS-Excel ("Pivot-Tabelle") für den Anfang ganz gut.
Auf jeden Fall solltest Du dich mit dem Thema DWH aussernander setzen.