Such mal auf tuxmobile.org in einer der vielen XF86Config Beispieldateien, in denen vielleicht die gesuchte Konfiguration drinsteht.
Ungefähr kann ich es dir auch sagen:
Eine "Maus" wird als Corepointer definiert (also bei dir die USB-Maus), die andere bekommt die Option "SendCoreEvents". Ich würde es allerdings andersrum machen, weil evtl. X sonst beim start ohne USB-Maus meckert. Touchpad deaktivieren ist nicht ganz so einfach. Wenn es von Synaptics ist dann gibt es ganz gute Linux treiber dafür. Evtl. kannst du das dann über USB Hotplug konfigurieren, dass, sobald du eine USB-Maus einsteckst das touchpad deaktiviert wird.
Touchpad wird normalerweise als PS/2 maus von Linux erkannt. Vielleicht kannst du zum abschalten auch einfach das passende Modul aus dem Kernel schmeissen. Auf eigene Gefahr.
