Wie maggu2810 sagte ist compiz-fusion da. Das ist ein Zusammenschluss von compiz und Beryl (daher "fusion").
compiz-fusion ist ein WindowManager. Gnome und KDE sind mehr als "nur" WindowManager. Es sind Desktop Systeme. Der WM ist nur ein Teil von Gnome (Metacity) bzw. KDE (kwin).
compiz-fusion hebelt sich da einfach rein und schmeißt die nativen Gnome/KDE Teile raus. Zusätzlich kommt noch ein eigener Window-Decorator mit: "Emerald", der verziert dir dann die Fenster etwas ... "cooler" ... wenn du willst.
Alles klar?